深圳办理日本签证的步骤和所需材料如下：
选择办理渠道
可以选择前往深圳外事服务中心办理。
或者通过日本驻华大使馆指定旅行社进行办理。
准备基本材料
有效护照（原则上半年有效）。
签证申请表（需要粘贴本人照片）。
证件照（2张2寸白底近照）。
身份证正反面复印件。
户口本复印件（包括户主首页及本人页）。
在职证明及年收入证明（如银行流水）。
资产证明（如退休金证明、房产证明、股票交割单等）。
亲属关系公证书（如适用）。
在学证明书或毕业证书（如适用）。
特定人群额外材料
居住证明（仅限户口不属于相关使领馆领区内的申请）。
暂住证或居住证明。
职业证明（只限于持因私护照的申请者）。
所属单位的营业执照或经营许可证复印件（只限于持因私护照的申请者）。
提交申请并等待审核
准备好所有材料后，可以亲自送至指定旅行社或通过快递寄送。
旅行社或外事服务中心收到资料后，会进行核对和审核，然后递交至日本使领馆。
需要留意领事馆的电话抽查，并保持耐心等待签证审核结果。
领取签证
审核通过后，旅行社或外事服务中心会代领签证，并通知申请人领取护照和签证。
建议选择有经验的旅行社进行办理，以确保签证申请过程顺利并按时出签。