关于存货增值税的处理，以下是几个关键点：
一般情况
处置一般存货时，应按照适用税率缴纳增值税。
销项税的计算基于销售商品或劳务的销售额，扣除进项税额后，差额即为应缴增值税额。
注销清算
一般纳税人在注销清算后销售货物，通常按照3%的征收率缴纳增值税。
注销清算时未出售的存货，其留抵税额不予退税。
特殊情形
如果存货因管理不善被盗，需要做进项税额转出处理。
自然灾害导致的存货损失，进项税额可以正常抵扣，不需要转出。
合并重组
企业合并后，被合并企业的货物不视同销售，未抵扣的进项税额可结转到合并后的企业继续抵扣。
存货损毁
合理损耗的存货，增值税无需处理，损失可在企业所得税前扣除。
非正常损失的存货，增值税进项不得抵扣，企业所得税前扣除也有条件限制。
会计处理
增值税不计入存货成本，而是单独核算。
会计分录示例：
```
借：库存商品等
贷：应交税费-应交增值税（进项税额）
贷：银行存款等
```
请根据具体情况选择合适的处理方法，并注意遵循最新的税法规定和会计政策。