当客户遗失了发票，您可以按照以下步骤进行处理：
收集信息
确认发票的种类、号码、抬头等关键信息。
联系开票方
立即通知开票方，说明发票遗失情况，并请求协助处理。
报告税务机关
向主管税务机关报告发票遗失，并提供必要的证明材料。
根据规定，可能需要在报纸等媒体上发布遗失声明，声明发票作废。
补办发票
如果可能，请求开票方提供发票的复印件并盖章，以便客户入账。
对于增值税发票，可能需要向主管税务局申请开具未抵扣税证明，并办理红字发票冲销原发票后重新开具。
发票登记管理
财务人员应设置发票登记本，详细记录发票的购入和开出情况。
建立发票管理机制
考虑使用电子发票管理系统，对发票进行分类、存档和备份，防止类似情况再次发生。
遵守法规
根据《中华人民共和国发票管理办法》等相关法规，妥善处理发票的遗失和补办事宜。
请根据具体情况采取相应措施，并考虑咨询专业税务代理机构以获得更专业的指导