京东第三方运费计算规则如下：
包邮规则
购买商品免运费的情况包括：
单品金额超过59元即包邮。
同一店铺凑单最高满59元即包邮（特殊商品除外）。
运费收取方式
包邮：购买商品免运费。
凑单包邮：购买商品收运费，但符合凑单条件即可免运费。例如，店铺满59元包邮（特殊商品除外），即当用户提交订单时，选购该店铺非特殊商品的订单实际支付金额高于59元时，该商品即可免运费。
收运费：不满足包邮条件，则按商家规则收取运费。
特殊商品运费
图书类商品：
订单金额<49元，收取基础运费6元。
订单金额≥49元，不收取基础运费。
订单金额<99元，收取基础运费6元（不区分图书类）。
订单金额≥99元，不收取基础运费。
生鲜类商品：
订单金额<99元，收取基础运费12元。
订单金额≥99元，不收取基础运费。
非生鲜非纯图书订单：
订单金额<49元，0≤其中图书商品金额<29元，收取基础运费8元。
订单金额<49元，其中图书商品金额≥29元，收取基础运费6元。
49元≤订单金额<99元，收取基础运费6元。
订单金额≥99元，不收取基础运费。
会员权益
京东金牌会员及以下级别订单满39元即可免运费，钻石、企业会员最早全场可无限额免费运费。经过此次调整，所有的未满39元的小额订单都将加收运费。此外，所有级别会员的极速达服务都需要49元运费。
运费计算基础
京东的运费计算主要基于商品重量、体积、配送区域以及订单金额等因素。在国内，首重1公斤的费用通常为6.5元，续重每公斤2元。然而，对于新疆、西藏等偏远地区，首重1公斤的费用会相应增加至9元，续重每公斤5元。此外，不足1元的运费会按1元计算。
区域差异
京东的运费标准在不同区域有所差异。一线城市如北京、上海、广州等地的运费标准相对较低，而二三线城市或偏远地区的运费标准则会相应提高。这主要是因为物流成本在不同地区存在差异。因此，消费者在购买商品时，需要留意商品详情页中的运费信息，以便了解准确的运费金额。
总结：
京东第三方运费计算主要依据商品金额、是否为特殊商品、会员等级以及配送区域等因素。消费者在购买商品时，应仔细查看商品详情页中的运费标准，以了解具体的运费金额。