当信用卡发生恶意透支时，持卡人应当采取以下措施：
全额还款
如果条件允许，应尽快还清信用卡的逾期欠款、滞纳金和利息。
与银行协商和解
向银行说明自己的实际情况，尝试协商还款计划。
配合诉讼
如果无法与银行和解，且银行提起诉讼，持卡人应配合法院的诉讼程序。
报警处理
如果恶意透支行为涉及虚构交易等违法行为，持卡人应向公安机关报案。
刑事责任
根据《刑法》第一百九十六条的规定，恶意透支信用卡且数额较大的，可能构成信用卡诈骗罪，面临有期徒刑及罚金等刑事处罚。
信用影响
恶意透支会导致信用记录受损，影响将来与银行或其他金融机构的业务往来。
法律援助
如果持卡人经济困难，可以寻求法律援助或咨询专业律师。
请记住，持卡人应当合理使用信用卡，避免透支超过限额或期限，以维护个人信用记录。