在日本租房时，房租的支付方式通常有以下几种：
自动扣款
可以申请从银行账户直接扣款，方便快捷。
转账汇款
需要确定支付期限以避免逾期。
便利店支付
月底收到账单后，可在截止日期前前往便利店缴纳房租。
现金支付
如果距离房屋管理地点比较近，可以自行前往并直接以现金方式交房租。
其他支付方式
如通过不动产中介公司进行支付。
此外，租房时通常需要预先支付以下费用：
头金：
相当于1-2个月房租的费用，用于支付礼金、押金、中介手续费等。
押金：
相当于1-2个月房租，用于退房时扣除可能产生的清洁费、修理费等。
礼金：
通常为1个月房租，用以感谢房东，退房时不退还。
中介手续费：
通常是一个月的房租。
保证料（保证会社费用）：
通常为半个月至一个月的房租，用于租客未付租金时的担保。
管理费（共益费）：
通常为5,000-10,000日元/月，用于维护公共区域。
预付租金：
可能需要提前支付一到两个月的租金。
请注意，上述信息可能因地区、房东和中介公司的不同而有所变化。在签订租房合同时，务必仔细阅读合同条款，了解所有费用和支付方式。