处理跨市违章扣分的方法如下：
本人前往当地交管部门
携带驾驶证和行驶证的原件或复印件到当地交管部门进行处理。
根据交管部门工作人员的指示，办理相关的扣分手续并缴纳罚款。
通过异地朋友代办
如果有朋友在违章当地，可以将违章通知单、驾驶证、行驶证、身份证等证件的原件或复印件交给朋友，委托朋友代为办理。
需要注意的是，部分省市交管部门不接受他人代办，因此需要提前了解清楚相关规定。
通过违章代办机构
可以选择一些有正规资质和实力的违章代办机构，将相关证件和资料交给机构，委托其代为办理。
在代办前，需要与代办机构签订相关协议，避免后续产生不必要的纠纷。
邮政代缴
通过邮政代缴的方式处理违章罚款，但邮政部门只能代缴罚款，对于产生扣分的违章情况无法办理。
通过交管12123 App在线处理
可以通过交管12123 App查询和处理已成功备案的本人名下机动车的非现场交通违法行为。
可以选择在原籍的交管所或银行自助终端办理。
建议
选择最便捷的方式：根据自身情况选择最便捷的处理方式，如时间充裕可以选择亲自办理，时间紧张可以委托朋友或代办机构。
确认代办机构的资质：在选择代办机构时，务必选择有正规资质和实力的机构，避免上当受骗。
提前了解当地政策：在办理异地违章前，先了解当地交管部门的具体要求和流程，以免因不了解规定而产生麻烦。