在受贿案件中，如果受贿人不承认受贿行为，调查机关通常会采取以下措施来查明真相：
收集证据：
调查机关会收集所有可能的证据，包括行贿人的口供、受贿物品、财务记录、相关时间和地点信息，以及其他间接证据。
调查核实：
通过调查核实，调查机关会结合各种证据来推断是否存在受贿行为。
审查反证：
调查机关还会审查受贿方是否有抵触或否定受贿行为的证据。
法律程序：
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》，如果没有确凿证据证明受贿行为，根据无罪推定原则，受贿人将被判定无罪。
纪委介入：
在某些情况下，如果有必要，调查机关可能会请求纪委介入调查。
庭审判断：
在庭审过程中，法官会根据收集到的所有证据进行判断，如果证据不足以证明受贿行为，则受贿人将被判定无罪。
请记住，证据是定罪的关键，没有充分证据支持的情况下，不能仅凭受贿人的否认就定罪