特殊工种档案的补办流程通常包括以下几个步骤：
检查丢失材料
确认丢失的材料内容，列出清单。
准备补办所需的申请材料，如补办申请书、身份证复印件及原件、工资卡复印件等。
提交补办申请
与所在企业或工作部门联系，提交补办申请。
企业或工作部门审核申请，确认工作经历，并提供相应的证明材料。
补办材料
补办可用的材料，如工资发放表格、健康津贴记录、医院体检表格等。
对于无法补办的材料，提供相应的证明。
劳动仲
如果单位未审批通过，且员工已达到退休标准，可申请劳动仲裁以保障个人权益。
特殊工种退休条件
男性年满55周岁，女性干部50周岁，女性工人45周岁。
缴费年限满15年。
所从事工种在国家特殊工种目录内，并达到规定年限。
有毒有害工种满8年以上，高温井下满9年以上，高空特别繁重满10年以上。
请根据以上步骤操作，并确保所有步骤符合当地劳动法规和档案管理规定。