楼顶烟道进水是一个比较常见的问题，以下是一些处理建议：
临时应急措施
封堵烟道开口：将烟道的两个开口（通常是四个方向）堵死后，使用防水涂料均匀涂刷。如果还有漏水，可以使用高压注浆机将专用水性防水涂料注入混凝土内的毛细孔中，以封死漏水点。
增加防雨设施：在烟道出口处增加防雨水的装置，以防止雨水进入烟道。
根治方法
拆除保温层和旧防水层：将渗水部位周围的保温层砸开，破坏原有的防水层，然后在原混凝土层上重新做防水处理。
重新做防水层：将烟道渗漏处周边300mm内的防水层铲除，并清理干净，然后采用相同或相容的防水材料进行修补，最后进行适当的养护。
联系专业维修
找开发商或物业：如果顶楼烟道漏水发生在交房五年以内，处于保修期内，可以联系开发商进行维修。如果漏水问题是由于公共设备损坏，可以动用维修基金进行维修。
专业修缮队伍：建议找专业的修缮队伍进行防水维修，以确保维修质量和效果。
预防措施
定期检查和维护：定期检查烟道及其接口，及时清理油污和污垢，确保烟道畅通无阻。
使用防水材料：在烟道出口处使用防水百叶窗等装置，以减少雨水渗透的可能性。
根据以上建议，可以根据具体情况选择合适的处理方法。如果漏水问题较为严重或涉及公共设备，建议联系专业维修队伍或开发商进行处理。同时，定期检查和维护烟道也是预防类似问题再次发生的重要措施。