如果您在菲律宾工作，而公司扣押了您的护照，您可以采取以下步骤来解决问题：
联系当地华人社团或律师
向他们咨询您的权利和可能的法律途径。
联系中国驻菲律宾使领馆
请求帮助追回护照。
提供您的个人信息，并按照使领馆的要求进行身份核实。
在核实身份后，使领馆可能会给您出具“旅行证”，以便您在没有护照的情况下回国。
补办旅行证
如果您无法取回护照，可以考虑前往中国驻菲律宾使领馆补办旅行证。
办理旅行证通常需要三到五个工作日。
所需材料可能包括身份证、护照首页照片、遗失证明等。
补办护照
如果您需要补办护照，通常需要向大使馆提交相关文件，如入境签证、护照照片、遗失证明、身份证原件或照片等。
补办护照的过程可能比较复杂，因此请确保您有所有必要的文件。
安全考虑
在前往使领馆或移民局时，选择安全的交通方式，如使用当地的打车App（如Grab）以减少风险。
请记住，在采取任何行动之前，确保您了解当地法律和规定，并考虑咨询专业法律人士的意见。