自考本科档案丢失的补办流程通常包括以下几个步骤：
联系自考办
向当地自学考试办公室报告档案丢失情况，并咨询补办流程。
准备证明材料
身份证原件及复印件。
毕业证书原件及复印件。
学籍证明或成绩单复印件（如有）。
其他可能需要的证明材料，如实践环节考核证明等。
开具遗失证明
到所在单位的人事部门或档案管理部门开具学籍档案遗失证明，并由单位盖章确认。
提交补办申请
携带遗失证明和相关材料，前往所在省（市）的自考办公室申请补办学籍档案。
审核材料
办公室会对提交的材料进行审核，确认无误后，将开始补办学籍档案。
领取补办档案
补办完成后，办公室会通知领取补办好的学籍档案，并仔细检查档案的完整性和准确性。
档案托管
补办好的自考档案不能单独存档，需要找到自考之前的统招学历档案或人事档案，然后合并存档。
请注意，补办流程可能因地区或具体情况有所不同，建议直接咨询当地自考办以获得最准确的信息和指导