办理养殖工商执照的流程如下：
提出申请
首先，需要到当地的畜牧局或者农业局提出申请，具体申请流程当地应该都有详细规定，地区不同，具体步骤不同。
土地使用申报及审批
向国土部门进行土地使用申报，以及涉及其他新建建筑的审批。
国土部门批复的文件，再递交畜牧局。
联合审批
畜牧局联合国土部门、环保部门、防疫部门等一起实地考察审批。
提交申请材料
办理个体养殖户工商营业执照，需提交以下材料：
到工商所领取个体工商户设立登记申请表。
申请人身份证复印件及一寸近期免冠照片一张。
经营场地证明。
公司法定代表人签署的设立登记申请书。
全体股东指定代表或者共同委托代理人的证明。
公司章程。
股东的主体资格证明或者自然人身份证明。
载明公司董事、监事、经理的姓名、住所的文件以及有关委派、选举或者聘用的证明。
公司法定代表人任职文件和身份证明。
企业名称预先核准通知书。
公司住所证明。
领取养殖证
最后一步，考察通过即下发养殖证，不通过则再次进行审批申报。
办理动物防疫合格证
携带《个体工商户名称预先核准通知书》、经营场地的房地产证明文件（或者土地使用权证书）的复印本、一张规格为一寸的个人照片以及经营者的身份证复印本至当地的工商业行政管理部门申请领取《动物防疫合格证》。
领取营业执照
成功获取《动物防疫合格证》之后，携带该证书正副本以及与之相配套的经营场地房地产证明文件（或者土地使用权证书）的复印本、一张规格为一寸的个人照片以及经营者的身份证复印本再次前往工商业行政管理部门，申请办理个体工商户营业执照。
建议：
在办理过程中，务必按照当地的相关规定和流程进行，确保材料齐全、真实有效。
如果遇到问题，可以及时咨询当地畜牧局、农业局或工商部门，获取详细的指导和帮助。