国家申请养殖项目的流程如下：
申请
单位和个人使用海域和内陆水域从事养殖生产活动的，应向县级以上地方人民政府渔业行政主管部门提出申请，填写申请表。单位还应提交与养殖规模相适应的资信证明材料、养殖技术条件说明等。
审核
县级以上地方人民政府渔业行政主管部门应认真审查申请材料，并会同有关单位人员进行现场勘验，确认标界，核实有关情况。
批准
经审核，对符合规定的，渔业行政主管部门应报请有审批权的人民政府批准，颁发养殖证。
登记造册、公告
渔业行政主管部门对已颁发的养殖证应登记造册，颁证海域和内陆水域要作图标志，及时向社会公告。
养殖场备案登记
养殖户需要向当地的农业行政部门申请备案，备案条件是具有一定规模的养殖场。主要流程包括备案申请、资料审查、核查备案和备案公告。
动物防疫条件合格证
这个证明是养殖场、养殖小区、畜禽隔离场所和一些畜禽肉类加工和无害化处理工厂，经过相关管理部门的审查，符合条件所颁发的许可凭证。养殖户要向当地政府和兽医管理部门提出申请，有关部门在20个工作日内会完成相关材料和现场审查，合格后会颁发。
养殖档案
养殖档案包括畜禽品种、数量、种苗来源和进出栏记录、饲料药物名称、类型等一系列问题，所以要依法建立养殖档案。
环保手续
从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。环评手续需到环保局办理。
排污许可证
养殖场在建设过程中需要办理排污许可证。
其他相关许可证和证明文件
根据养殖场的经营范围和规模，可能还需要办理其他相关的许可证和证明文件，例如野生动物驯养繁殖许可证、工商营业执照、税务登记证等。
缴纳相关费用
在申请和注册过程中，需要缴纳相应的费用。
项目申报通知和项目申请报告
及时获取项目申报通知，并编写项目申请报告，结合自身情况，切实可行是项目申报成功的关键之一。
政府关系和沟通
及时沟通、规范运作，多和地方政府沟通，多和专家沟通，让其帮助支招，把项目做好。
建议：
在申请养殖项目前，建议详细阅读当地的相关规定，并咨询当地有关部门或者专业人士的意见，以便顺利申请相关手续。