申请畜牧养殖补贴需要遵循以下流程和准备相关材料：
备案登记
养殖户需要向当地的农业行政部门申请备案，备案条件是具有一定规模的养殖场，具体规模标准看当地政府设置。
提交的材料包括《养殖场养殖小区备案表》3份、养殖场养殖档案原件及复印件各一份、《动物防疫条件合格证》原件及复印件各一份、企业营业执照和法人身份证原件及复印件各一份、建设项目环境影响报告原件及复印件各一份。
备案申请后，农业主管部门会在15个工作日内完成考核，考核合格后出具《受理通知书》。
准备补贴申请材料
种公羊补贴：需要提供种公羊照片、系谱档案、供种单位种畜禽生产经营许可证、购买合同或收据或支付凭证等购买证明材料、购买人身份证复印件。
肉牛良种冻精补贴：需要提供养殖场存栏信息、系谱信息、登记造册、建档立卡情况、购买冻精证明材料。
养殖补贴：需要提供养殖场备案登记、动物防疫条件合格证、养殖档案等材料。
项目申报
及时获取项目申报通知，关注国家部委及养殖者所在省、市相关网站。
筛选适宜的项目进行申报，并编写项目申请报告。
按照项目通知要求，准时呈报给对口的部门。
项目实施与验收
在项目实施过程中，要规范运作，专款专用，确保资金用途明确。
关注项目实施验收信息，及时掌握验收考察信息，做好充分准备。
资金拨付
项目通过审核和验收后，资金会直接拨付到农户指定的账户。
建议养殖户在申请补贴前，先与当地农业部门或畜牧部门沟通，了解具体的补贴政策和申请条件，确保所有材料齐全、符合要求，以提高申请成功率。