戈麦斯离开拜仁的原因主要包括以下几点：
伤病问题：
在2012-13赛季，戈麦斯因伤病主要担任曼朱基奇的替补，虽然随队取得了三冠王，但个人表现受到了影响。
战术不匹配：
戈麦斯透露，瓜迪奥拉不喜欢纯正中锋的战术，这导致他在拜仁无法在中路起到支点作用，对球队整体战术的支持有限。
俱乐部关注点：
戈麦斯感到自己在俱乐部的地位被边缘化，尤其是在俱乐部一心引进莱万多夫斯基的过程中，他没有感受到足够的支持。
个人职业规划：
戈麦斯在采访中提到，他早在2013年夏天就打算离开拜仁，因为他了解到瓜迪奥拉不需要纯正中锋，而他留在拜仁将不得不继续执行瓜迪奥拉的战术。
以上几点综合起来，是戈麦斯选择离开拜仁的主要原因