福建的水质总体上是良好的，但存在一些局部污染问题。以下是一些关键点：
畜禽养殖污染：
部分地区畜禽养殖污染严重，尤其是小而散的养殖户，导致大量养殖废水排入水体，COD和氨氮超标。例如，延平区、新罗区、福清市、武平县等地的小而散生猪养殖户问题仍然存在，且福清迳江河迳江桥断面连续多年监测均为劣Ⅴ类水，主要污染源来自畜禽养殖。
地表水水质：
2013年福建省水环境质量总体保持优良，全省12条主要河流水质保持为优，水域功能达标率98.4%，Ⅰ~Ⅲ类水质占比95.2%。
海域水质：
福建省部分海域在特定时期会出现赤潮现象，但总体水质呈现好转趋势，且没有新增养殖损失。
养殖技术：
福建的养殖技术在不断进步，例如“冬棚”养殖技术已经相当成熟，可以实现高产。
饮用水源地：
福建省的集中式生活饮用水源地水质达标率非常高，9个设区城市、平潭实验区、14个县级市、44个县城的水源地水质达标率分别为99.4%、100%、99.7%、100%。
综合来看，福建的水质在整体上较为优良，但在某些局部地区，如畜禽养殖密集区，仍存在较为严重的污染问题。建议继续加强环保措施，推广规模化、标准化的养殖方式，以减少对水体的污染。