土地出让金的计算方法如下：
有实际成交价的
如果成交价不低于所在级别基准地价平均标准，则按成交价不低于40%的标准计算出让金。
如果成交价低于基准地价平均标准，则按全部地价的40%计算。
在原土地拥有者转让土地补办出让时
按基准地价平均标准的40%计算土地出让金。
通过以上方式计算的土地出让金数额有异议时
由受让人委托有资质的土地估价机构进行评估，按评估价的40%计算土地出让金。
划拨土地使用权成本价格占土地价格的最高比例不得高于60%
在以划拨土地使用权价格计算出让金时，必须将成本价格换算成市场土地价格，再按不低于40%的标准计算土地出让金。
具体计算步骤：
确定基准地价平均标准 ：根据土地所在级别查找相应的基准地价平均标准。计算实际成交价与基准地价的比较
若成交价不低于基准地价平均标准，则出让金 = 成交价 × 40%。
若成交价低于基准地价平均标准，则出让金 = 基准地价平均标准 × 40%。
对于划拨土地使用权补办出让
出让金 = 基准地价平均标准 × 40%。
对于异议的土地出让金数额
委托有资质的土地估价机构进行评估，出让金 = 评估价 × 40%。
额外费用：
印花税：
按产权转移书据（合同）所载金额的0.05%缴纳。
契税：按成交价格的3%缴纳（有的地方是5%）。
土地增值税：按取得收入减除规定扣除项目金额后的增值额缴纳，税率根据增值额与扣除项目金额的比例分为30%、40%和50%三档。
这些计算方法适用于不同情况下的土地出让金计算，确保合理且公平。建议在实际操作中，根据具体土地性质、交易情况以及相关法规进行详细计算。