从上海飞往日本的时间主要取决于您选择的航线和目的地。以下是一些参考时间：
上海到东京
一般飞行时间为2小时到4小时之间。
如果选择全日空特价班机，可能会中途停靠扎幌，再返回东京，总时间可能在2小时左右。
从上海浦东机场出发，到达东京的羽田机场大约需要2小时，到达千叶县成田机场大约需要2小时20分；从上海虹桥机场出发，到达东京羽田机场大约需要2小时15分钟，到达成田机场大约需要2.5小时。
上海到大阪
飞行时间大约为1.5小时到2.5小时之间。
从上海浦东机场出发，到达大阪关西机场大约需要1小时40分钟。
上海到其他城市
上海到长崎大约需要1小时左右。
上海到福冈的飞行时间也相对较短。
请注意，这些时间仅供参考，实际飞行时间可能会因天气、航班调度、机场跑道滑行时间等因素而有所不同。建议您在出发前查看具体航班的飞行时间，以获得最准确的信息。