港澳通行证是一种卡式证件，尺寸为8.9cm×6.4cm，采用护照材质，封面为红色。正面印有中文和英文的“中华人民共和国港澳通行证”字样，以及证件持有人的姓名、照片、性别、出生日期等个人信息。内页包括签发地、签发日期、有效期限等信息。
新版港澳通行证的特点如下：
类似于身份证大小的卡片，尺寸略小于户口簿。
正面打印持证人个人资料以及证件签发管理信息。
背面打印往来港澳签注等信息，签注信息可由证件签发机关重复擦写签发打印。
证件号以C开头，有效期为10年。
2014年9月15日起，全面启用电子港澳通行证，纸质港澳通行证已停止使用。