申请生猪养殖合作社的步骤如下：
预约登记合作社名称
到所在地行政大厅工商局窗口，携带5个人的居民身份证原件进行预约登记。
办理防疫合格证
前往所在行政大厅畜牧局窗口，办理防疫合格证。
准备合作社资料
合作社章程，包含5人出资明细及5人亲自签字。
房屋产权证明和经营场所证明。
5人身份证证明，必须有本村村委会盖章。
土地证明，去当地土管所办理。
环境评定证明，去环保局办理。
5人户籍证明，去当地派出所办理。
提交申请资料
将以上所有资料递交给当地工商所，等待审批。
领取营业执照及相关证件
在通过审批后，领取合作社法人营业执照。
办理合作社公章。
在质量技术监督局办理组织机构代码证。
在国家、地方税务局申领税务登记证。
在银行办理开户和账号。
最后，在当地农经主管部门备案。
建议：
在申请过程中，确保所有材料和手续都齐全且符合要求，以便顺利通过审批。
可以提前咨询当地工商局、畜牧局、环保局等相关部门，获取详细的指导和帮助。