办理淡水养殖场环保手续需要遵循以下步骤：
养殖用地证明
到国土资源局办理，一般符合养殖用地的都可以办理。
环评手续
到环保局办理，环保部门会有人员下来考察，只要排污合格的养殖场就可以。
需要带发展改革委的立项文件以及可研报告去找环评公司，环评公司会派人到加工场地进行现场勘查，编制环评报告后送给环保局评审，审批通过后公示，公示完了后会出具批复文件。
规划意见
养殖场设计好建设图纸，然后到规划局审核。
动物防疫条件合格证
向县级以上地方人民政府兽医主管部门申请。
排污许可证
根据实际情况办理，具体办理程序可咨询当地环保部门。
养殖证（野生动物驯养繁殖许可证）
国家要求海域水产养殖和内陆水域养殖户需要办理的证件；对于驯养繁殖可人工养殖的野生动物时，一定要办理野生动物驯养繁殖许可证。
工商登记
领取准予设立登记通知书后，去工商局领取营业执照。
其他手续
立案备案手续到发改委办理。
养殖场备案登记手续到畜牧局办理。
如果需要在养殖场内建设养殖厂房，需要单独向建设管理主管部门提出申请，经过审批后可以建设厂房。
建议：
办理环保手续时，建议提前咨询当地相关部门，确保所有手续和证件齐全，避免因手续不全而导致后期运营出现问题。
严格按照国家相关法规和政策进行养殖场的建设和运营，确保符合环保要求，避免因环保问题而产生法律风险。