去除水系石材上的水垢可以采用以下几种方法：
小苏打除水垢
在水中放入1小勺小苏打，烧沸几分钟，然后淋在石头上刷洗干净即可。
柠檬除水垢
将柠檬切片放入烧水壶，水烧开后煮沸5分钟左右，然后让柠檬在水中浸泡2分钟，最后淋在石头上刷洗，可以除去水垢。
水垢清洁剂
使用含有羟基丙三酸的水垢清洁剂，这种清洁剂使用便捷且效果好，适合家庭用户使用。
纳米海绵
使用纳米海绵轻轻擦拭水垢和水锈，不需要其他清洁剂或材料，纳米海绵的物理吸附作用能够有效去除污渍。
石材清洗剂
使用专门针对天然石材水垢和污渍的清洁产品，如思诺306石材清洗剂，将适量的清洗剂倒在抹布上，轻轻擦拭石材表面，然后用清水冲洗干净。
食醋
将食醋与水稀释后，用抹布蘸取溶液轻轻擦拭水垢，食醋中的酸性物质能够分解水垢。
鸡蛋液和食盐
在有水垢的地方滴几滴鸡蛋液，撒上少量食盐，10分钟后进行擦拭。
石材专用药膏
准备由面粉和液体洗涤剂混合的药膏，涂抹在污渍上，盖上塑料膜，放置过夜后刮掉药膏，用清水和中性洗涤剂清洗残留物。
这些方法各有优缺点，可以根据实际情况选择适合的方法进行尝试。例如，小苏打和柠檬方法适用于较为温和的除垢，而纳米海绵和石材清洗剂则适用于较为顽固的水垢。食醋和鸡蛋液则适用于轻度水垢的去除。