办理生态养殖业的手续包括以下几个关键步骤：
申请规模化畜禽养殖项目
向乡（镇）人民政府提出申请，并经过其同意。
向县级畜牧主管部门提出规模化养殖项目申请，并进行审核备案。
用地备案手续
本农村集体经济组织、农民和畜牧业合作经济组织申请时，经县级畜牧主管部门审核同意后，乡（镇）国土所要帮助协调用地选址，并到县级国土资源管理部门办理用地备案手续。涉及占用耕地的，要签订复耕保证书，原则上不收取保证金或押金；原址不能复耕的，要依法另行补充耕地。
其他企业或个人申请时，经县级畜牧主管部门审核同意后，县（市）、乡（镇）国土资源管理部门要积极帮助协调用地选址，并到县级国土资源管理部门办理用地备案手续。生产设施及绿化隔离带用地占用耕地的，应签订复耕保证书，原址不能复耕的，要依法另行补充耕地；附属设施用地涉及占用农用地的，应按照规定的批准权限和要求办理农用地转用审批手续。
环保手续
到环保局办理环评手续，环保部门会有人员下来考察，只要排污合格的养殖场就可以。
养殖项目属于易造成环境污染的项目，从选址到最终养殖场生产运行整个流程都需要通过环评进行认定和分析预测，需要配套建设污染防治设施。
在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须按规定取得《排污许可证》，并按照《排污许可证》的规定排放污染物。
动物防疫条件合格证
养殖场选址应符合《动物防疫条件审查办法》的相关规定，向县级畜牧主管部门申报备案，取得畜禽标识代码。
工商登记和备案手续
办理工商登记，并办理养殖场备案登记手续。
其他可能需要的证件
根据具体情况，可能还需要办理野生动物驯养繁殖许可证等其他证件。
建议
提前规划：在申请之前，应先进行详细的场地规划和设计，确保符合当地土地利用规划和环保要求。
咨询专业机构：在办理手续过程中，可以咨询当地国土资源局、环保局、规划局等相关部门，获取详细的指导和帮助。
严格按照流程操作：按照上述步骤逐一办理手续，确保每一步都符合法律法规要求，避免因手续不全而导致审批失败。