如果您的养殖厂厂房被拆，可以采取以下步骤来办理：
报警处理
如果养殖厂被强拆，您可以直接向当地公安机关报案，以维护自己的合法权益。依据《国有土地上房屋征收与补偿条例》，被拆迁人遭遇到强拆的，可以到公安机关报案。
收集证据
在遭受侵害时，您应当立即报警求助，并尽可能收集现场证据，如房屋的内部结构和外部结构受损程度、相关主体在进行房屋拆迁时的录音和录像等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
申请行政复议
如果对违章建筑的认定有争议，您可以在规定的时间内申请行政复议。根据《行政复议法》，您可以在知道具体行政行为之日起六十日内提出行政复议申请。
提起行政诉讼
如果通过行政复议无法解决问题，您可以在适当时机向法院提起行政诉讼，要求行政机关进行损害赔偿。在诉讼过程中，您需要提供证据证明强拆行为违法，并据此要求相应的赔偿。
与政府部门沟通
您可以与政府有关部门进行沟通，了解政府强拆的具体原因和程序，协商解决方案，争取合理的补偿和安置。
寻求法律帮助
如果养殖户认为政府的强拆行为违法或者侵犯了自己的合法权益，可以寻求律师或者法律援助机构的帮助，依法维护自己的合法权益。
组织维权
养殖户可以与其他受影响的养殖户进行联合组织，共同维护自己的合法权益，通过集体维权的方式争取更多的合理利益。
请记住，维权过程中应保持冷静，通过合法途径解决问题，避免采取暴力或非法手段。同时，及时咨询专业律师，获取详细的法律建议和指导，以确保您的权益得到最大程度的保护。