当养殖场存在违建行为时，需要按照以下步骤进行处理：
立案
养殖场违建问题需由相关责任单位或个人向有关部门进行举报或申报。
可以向当地的城市规划部门、农业执法局等相关部门进行举报。
调查
立案后，有关部门将组织人员进行现场调查，并收集相关证据。
调查内容包括养殖场的违建情况及其对环境和周围居民的影响。
违建确认
相关部门将根据国家和地方的相关规定，对养殖场的违建行为进行鉴定和确认。
违法行为可能包括建设起重肉牛舍等与规划不符、未经合法审批建设的污水处理设施等。
处罚或整改
一旦违建行为被确认，相关部门将依照法律法规进行处罚或整改。
处罚可能包括罚款、责令停产停业、撤销相关资质等。
整改要求养殖场责令限期进行合法化或拆除违建，恢复原状。
环境修复
养殖场违建所造成的环境污染或破坏也需要进行修复和治理。
相关部门应监管养殖场进行环境修复工作，确保其符合相关环境要求。
在处理养殖场违建问题时，有关部门应加强监管和执法力度，对违建行为严肃处理，确保养殖场生产经营活动符合相关规定，保护环境和人民群众的利益。