在乡镇上办理养殖场证件的流程如下：
提出申请
首先需要向乡镇级别的农业局或畜牧局提出养殖场的申请，填写相应的申请表。
土地使用申报
到当地的国土部门进行土地使用权申报，可能涉及到新建建筑的审批项目。
环保手续
到环保局办理环评手续，环保部门会进行实地考察，确保排污合格。
规划意见
养殖场设计好建设图纸后，需到规划局审核，获取规划意见。
立案备案手续
到发改委办理立案备案手续，最好与村委会一起办理，以确保流程顺利进行。
动物防疫条件合格证
在畜牧局办理动物防疫条件合格证，确保防疫设施到位。
生产经营许可证
先让村委会证明，然后到畜牧局审核，最后到工商局办理生产经营许可证。
野生动物驯养繁殖许可证 （如适用）：
取得生产经营许可证后，需到畜牧局办理检疫证，再到林业局办理野生动物驯养繁殖许可证。
实地考察
畜牧局会联合国土部门、环保部门、防疫部门等进行实地考察，考察通过后下发养殖证。
工商登记
最后，携带所有相关文件到工商部门办理个体工商户营业执照。
建议：
在整个办理过程中，建议与当地的村委会、国土部门、环保部门、畜牧局、工商局等相关部门保持密切沟通，确保每一步流程都能顺利进行。
准备好所有必要的文件，并按照上述流程逐步办理，以确保养殖场的合法性和顺利运营。