处理石材凸出的问题，可以根据具体情况采取不同的方法。以下是几种常见的处理方式：
手工磨削
使用角磨机手工将凸起的石材磨削掉，适用于小面积的凸起。这种方法适用于对石材表面要求不是非常高的场合。
机械雕刻
利用数控雕刻机等设备进行精确雕刻，可以实现复杂的凹凸效果。这种方法适用于需要高精度和复杂图案的场合。
喷砂加工
在石材表面使用高压气流喷射沙粒，通过摩擦作用形成凹凸不平的纹理。这种方法适用于需要特殊纹理效果的场合。
磨光与抛光
通过不同粒度的砂纸或者抛光机械对石材表面进行处理，使凹凸的部位与平面之间形成鲜明的对比，增强视觉效果。这种方法适用于需要恢复石材原有光泽的场合。
破损修补
首先将石材原有破损的表面用接近石材颜色的云石胶进行填补，然后使用专用的石材开缝机对原来石材安装的中缝重新整齐切割开缝，使缝隙的宽度变的差不多，再用接近石材颜色的云石胶对其进行填补。这种方法适用于石材表面有破损的情况。
灌浆处理
在空鼓处开孔，然后灌入水泥胶浆，灌的时候可以用橡皮锥震动，等水泥胶浆凝固后，再进行打磨处理，使得表面保持平整。这种方法适用于石材空鼓的情况。
整体抛光
如果石材地面整体亮度不高，建议在石材修复的同时，做整体抛光，这样可以避免具备光泽不统一的现象，提高石材的整体装饰效果。
根据以上方法，可以根据石材凸出的原因、大小、位置以及美观度要求，选择最合适的处理方式。如果需要更专业的建议，建议咨询专业的石材护理公司。