养殖业环保不合格的情况下，可以采取以下措施进行整改：
提高环保意识
养殖企业应认识到污水排放对环境的危害，明确自身在环保方面的责任。
优化养殖管理
合理规划养殖规模，避免过度养殖。
改进饲料配方，减少氮、磷等污染物的排放。
加强污水处理设施建设
根据养殖规模和污水特点，选择合适的处理工艺，如生化处理、湿地处理等。
定期检测污水排放指标，及时发现问题，采取措施加以整改。
引入新技术
推广清洁生产，加强能源管理，降低能源损耗。
推进动物废弃物资源化利用，如通过建设沼气发酵设施将畜禽粪便转化为能源。
加强监管和执法
政府应加大监管力度，严格执行环保法律法规，对违规排放的企业进行处罚。
推广环保养殖技术
鼓励企业采用先进的养殖模式和技术，降低污水排放。
建立环保养殖示范区，推广成功的经验和做法。
完善环保设施和管理制度
养殖场应建立健全与生产方式、产业结构转型升级相适应的环保监管体系。
加强废水、废气、废弃固体物的无害化处理设施建设，建设严格的环保设施和管理制度。
加强环境监测和兽医管理
对养殖场废水、废气、废固体物进行实时监控，及时处理。
提高动物疫病防控水平，采取科学、严谨、合理的用药手段，减少兽药残留物。
政策支持和资金投入
政府提供财政补贴和技术支持，鼓励养殖户采用环保养殖技术。
建立环保养殖示范区，推广成功的经验和做法。
通过上述措施，养殖业可以在一定程度上解决环保问题，实现绿色、可持续的发展。