要去掉石材上的防水层，可以尝试以下方法：
使用石材除漆剂
如果石材上被涂了防水漆，可以使用专门的石材除漆剂来去除。将除漆剂敷盖在防水层上，让其浸润一段时间，待漆层脱皮后，用干净的抹布擦拭即可。
加热法
通过使用喷灯或高温灯进行烘烤，可以去除石材上的水斑。这种方法在短时间内可能会有一些效果，但施工后一段时间内，水斑可能会恢复到原来的状况。此外，如果石材底面防护剂使用不当，经过烘烤还可能造成石材的空鼓。
建议根据具体情况选择合适的方法，并确保操作过程中对石材的保护，避免造成损伤。如果不确定如何操作，建议咨询专业的石材护理人员。