当快递在菜鸟驿站丢失时， 一般应由驿站承担责任。以下是具体的赔偿方式：
未保价快递
信件类按本次服务费用的2倍赔偿。
包裹类按实际损失价值赔偿，但最高不超过本次服务费用的5倍赔偿。
已保价快递
按保价金额的2%计收保价费。
快件发生丢失时，按照被保价金额进行赔偿，保价最高限额为每票人民币壹万元整。
不可抗力因素
自然灾害、空难、战争、交通事故、政府行为等不可抗力造成的延误及损毁，快递公司不负其责。
其他损失
对于其他损失或间接损失，快递公司不承担赔偿责任。
赔偿流程
首先可以与菜鸟驿站的负责人投诉，看看是否能解决问题。
如果菜鸟驿站负责人不能解决问题，可以向驿站的上一级投诉。
建议：
在寄快递时，建议选择保价服务，以便在发生丢失时能够获得更高的赔偿金额。
在收到快递时，务必仔细检查，确保物品完好无损，避免因未及时发现问题而影响赔偿。