华佗的死因主要是因为他得罪了曹操，最终被曹操在狱中拷问致死。华佗是东汉末年的著名医学家，因其医术高超而被后人尊称为“外科圣手”和“外科鼻祖”。他因拒绝为曹操治疗头疼而被曹操怀疑有谋害之意，最终被下狱拷问。曹操认为华佗的医术虽高，但其行为被视为欺君，最终下令将其处死。
具体来说，华佗在建安十三年（公元208年）就已经去世，当时他因拒绝为曹操治疗头疼而被捕，最终惨死在狱中。曹操认为华佗想要利用自己的医术来谋取更高的地位，因此对他产生了怀疑并下令处死。华佗在临死前，将其医书《青囊经》交给狱吏，但狱吏因害怕触犯法律而不敢接受，华佗最终将书烧掉，以免其医术失传。
综上所述，华佗的死因是因为他拒绝为曹操治疗头疼，被曹操怀疑有谋害之意，并在狱中遭受拷问致死。