石材防水的除去方法主要有以下几种：
物理烘烤法
利用高温高热的作用析出碱-硅胶体中的水分，使其变成固态胶体后，再采用石材养护剂进行防水处理。这种方法只处理了石材的表面部分，当碱-硅胶体变成固态后，又会马上从石材底部及四周吸收水分，重新形成水斑。
化学清洗法
使用石材水斑清除剂进行清洗，清除或破坏石材中形成水斑的碱或碱-硅酸凝胶体（C-S-H），使其失去吸潮能力，从而达到治理水斑的目的。
清洗烘烤综合法
先利用石材水斑清除剂清除或破坏石材中形成水斑的碱-硅酸凝胶体（C-S-H），再用烘烤法烤干石材中水分。
增艳调色法
通过增色的方法将有水斑病变的石材中颜色较浅的部分石材颜色加深，使其达到与深色部分石材的颜色相同或接近，从而达到美观的装饰效果。
防护处理
在石材清洗干净后，在石材表面干燥的情形下，再作一道防护处理的工作，使用渗透性的防护剂，如客林KL10829墙体防水宝、KL10849石材保护剂等，这些防护剂可以渗入石材内部，形成一道防护层，具有防水、防污、防止泛碱等效果。
密封处理
对于干挂石材的漏水问题，需要使用密封胶在外墙缝隙处进行填充工作，并在屋顶干挂石材和外墙的缝隙处做泛水封闭。
建议根据石材的具体情况和需求选择合适的方法进行防水处理。如果水斑问题严重，可能需要综合使用多种方法以达到最佳效果。