迈克尔·乔丹第二次退役的原因是多方面的，主要包括以下几点：
个人挑战：
乔丹在篮球场上已经找不到真正的对手，他感到了一种前所未有的孤独和寂寞。
竞技状态：
虽然乔丹在34岁时再次实现了对荣誉的包揽，但他心里明白自己的竞技状态在下滑。
球队状况：
公牛队的老化和内部矛盾可能也是乔丹想要退役的原因之一。
劳资谈判：
1998年NBA劳资谈判陷入僵局，乔丹表示没有作为运动员的挑战目标，这也是他选择退役的一个原因。
家庭因素：
乔丹在1993年因为父亲去世而退役，并在之后尝试了棒球生涯，但发现自己还是更喜欢篮球。
心理和情感：
乔丹在处理个人生活和家庭需要更多的关注和投入，这也是他选择退役的一个因素。
其他因素：
有报道指出，乔丹的退役与菲尔·杰克逊和斯科蒂·皮蓬等队友的关系也有一定影响。
综合以上因素，乔丹的第二次退役是一个由个人选择和环境因素共同作用的结果