Cy5.5是一种 近红外荧光染料，也被称为花菁染料5.5。它属于Cyanine染料系列，由两个相连的氮杂环通过一个五碳链连接，两端通常连接有电子吸引基团，如吲哚环。Cy5.5具有在可见光和近红外区域吸收和发射光的能力，其激发波长约为675 nm，发射波长约为695 nm。这种染料具有以下特点：
高消光系数：
意味着它在特定波长下的光吸收能力很强。
高荧光亮度：
在生物成像中能够产生较强的信号。
pH不敏感：
在生理pH条件下稳定性好，适合用于体内成像。
近红外波长：
其发射波长（约700 nm）处于生物组织的近红外窗口，能够有效降低组织散射和吸收，提高成像的清晰度。
Cy5.5常用于蛋白、抗体以及小分子化合物的标记，并通过简单的混合反应完成结合。它在生物医学研究、成像和生物传感器等领域有广泛应用，例如用于小动物活体体内成像、药物递送和靶向治疗等。