净化佛珠的方法有多种，以下是一些常用的方法：
净手和净意
在开始净化佛珠之前，首先要净手和净意，以表示对佛法的尊重。
使用御守盐
将10克御守盐放入净化碗中，然后加入适量的水，水位只需填满碗即可。如果没有净化碗，也可以使用自来水，并按照御守盐与自来水1:50的比例调制净化溶液。将佛珠放置在御守纸上，写上自己的名字、阴历生日和愿望，然后放入碗中，倒入清水，如果有过滤的器皿，可以将御守盐倒在上面。经过24小时的净化时间后，将佛珠捞起，御守纸晾干后焚烧。
阴阳水浸泡
将佛珠拆散，用搓澡巾搓一星期，不要用力，正常力度即可。然后用毛巾搓一星期，进行二次抛光。接着用棉布进行第三次抛光，需要细致地一个个珠子抛光。最后将棉布撕成细条，穿过珠子的孔道进行抛光，也可以用砂纸进行精抛。之后用手戴白手套盘玩一星期，每天30-60分钟，大概2个星期后会有薄薄的包浆。珠子静置一星期，再次自然干燥，包浆硬化后重复盘玩和干燥过程，大约三年左右包浆厚重，开片自然。
清水清洗
对于异味不重或表面脏污不严重的佛珠，可以用清水清洗，然后自然阴干。重复几次可以去掉异味和污物，之后放入沉香粉中保养。
温和擦拭
如果异味过重或表面污染严重，可以先用温热的毛巾热敷一段时间，再轻轻擦拭珠子表面。注意动作要轻柔，避免损伤佛珠。
使用小刷子
对于表面有胶状物质的佛珠，可以使用软毛刷或茶巾沾水拧干后擦拭，直到胶状物质去除，然后用纸巾吸干表面，放置一旁自然阴干。
综合清洁
准备干净毛巾、棉质手套、橄榄油、棕刷、牙刷、温水、钢针等工具。先用毛巾蘸水清理表面污垢，然后戴手套擦干，用棕刷或牙刷蘸橄榄油擦拭，最后用钢针剔除污垢。注意动作要轻柔，避免损伤佛珠。
建议
定期净化：佛珠在使用过程中会逐渐积累灰尘和污垢，建议定期进行净化，以保持其清洁和光泽。
根据材质选择方法：不同材质的佛珠需要采用不同的净化方法，例如木质佛珠不宜沾水，而石质佛珠可以碰水。
细心操作：无论采用哪种方法，都应细心操作，避免对佛珠造成损伤。