纯化菌的方法主要有以下几种：
倾注平板分离法
将微生物悬液进行一系列稀释后，取一定量的稀释液与已熔化并冷却至45℃左右的琼脂培养基混合均匀。
将混合液倾注到无菌的培养皿中，待凝固后倒置培养。
单细胞经过多次增殖后形成一个菌落，取单个菌落制成悬液，重复上述步骤数次，最终得到纯培养物。
涂布平板分离法
将微生物悬液进行适当稀释后，取一定量的稀释液放在无菌的已凝固的营养琼脂平板上。
用无菌的玻璃刮刀将稀释液均匀地涂布在培养基表面，经恒温培养便可以得到单个菌落。
平板划线分离法
用无菌的接种环取培养物少许在平板上进行划线，划线方法包括斜线法、曲线法、方格法、放射法、四格法等。
随着划线次数的增多，微生物被稀释，最终出现单一菌落。
组织分离法
从植物或动物组织中分离微生物，通过组织匀浆或切片的方法将微生物分散在培养基上，然后进行纯化。
富集培养法
创造特定条件，使所需的微生物有效与其他微生物竞争，从而在生长能力方面占据优势，实现微生物的富集和纯化。
这些方法各有优缺点，选择哪种方法取决于具体的实验需求、微生物种类以及所需的纯化程度。例如，倾注平板分离法适用于大规模菌落分离，而涂布平板分离法则更适合于观察菌落特征和进行菌种计数。平板划线法虽然操作简便，但可能需要多次划线才能达到纯化目的。