`CN3D` 是一个生物分子的三维结构、序列以及序列比对结果的可视化工具。它允许用户在线或离线查看和分析蛋白质的三维结构，并通过结构比较来理解不同生物分子结构之间的相似性和差异性。CN3D特别适用于科研人员快速识别与疾病相关的蛋白结构变异，以及研究蛋白家族中保守的活性位点残基。
CN3D的主要特点包括：
结合了结构与序列信息，帮助用户理解生物分子；
支持读取MMDB格式文件，并能输出为PDB格式文件；
提供在线客户端和离线模式，便于用户交互式地观察和分析蛋白序列；
可以通过基于结构的序列比较来显示生物分子结构之间的比较。
CN3D是生物信息学和结构生物学领域中一个有用的工具，广泛应用于科研和教育领域