凝胶色谱，也称为分子排阻色谱，其分离原理基于分子筛效应。具体来说：
分子筛效应：
当含有不同分子的样品溶液缓慢流经凝胶色谱柱时，分子在柱内进行垂直向下的移动和无定向的扩散运动。大分子由于其尺寸较大，不易进入凝胶颗粒的微孔，而只能分布在颗粒之间，因此向下移动的速度较快。相比之下，小分子物质除了在颗粒间隙中扩散外，还可以进入凝胶颗粒的微孔中，导致其下移速度落后于大分子物质。
固定相与流动相：
凝胶色谱的固定相为多孔性凝胶，流动相为水溶液或有机溶剂。不同大小的分子根据其体积与凝胶孔径的匹配程度，在固定相中的迁移速度不同，从而实现分离。
凝胶的选择：
通过调整凝胶的交联度可以改变凝胶孔隙的大小，进而影响分离效果。此外，流动相的组成也会影响凝胶的溶胀状态，从而改变孔隙大小。
应用范围：
凝胶色谱适用于分离有机大分子化合物，如蛋白质、多肽、多糖等，并且可以用于生物大分子的净化与富集。
总结来说，凝胶色谱利用凝胶的分子筛作用，根据分子大小的不同进行分离，大分子物质由于不能进入凝胶的微孔而快速流出，小分子物质则因为能进入微孔而流出较慢，从而实现分离