养殖大棚的确权流程如下：
符合设施农用地要求
养殖业主的设施用地首先要符合设施农用地要求，并完成设施农用地审批备案，取得土地承包经营权或土地经营权。这一过程需要遵守《农村土地承包法》《农村土地经营权流转管理办法》等相关规定。
申请与审核
养殖业主准备相关资料后，向县级农业农村部门提出申请。农业农村部门负责审核申请，并组织测绘工作。
登记与发证
审核通过后，由不动产登记部门进行记载并核发不动产权证书。在土地承包经营权或土地经营权等证书附记栏中，需要记载畜禽养殖设施的基本信息，包括畜禽养殖圈舍、饲料储存与生产配制车间、粪污处置设施、防疫设施、管理用房等附属设施，但不包括特种畜禽养殖设施。
其他相关手续
如果涉及农用地转用，需要先办理农用地转用手续，并可能需要得到村民小组的同意及上级主管部门的批准。此外，还需要向畜牧管理部门申请养殖项目，如果是建种畜场，还需申请良种繁殖许可证。
处理纠纷
如果出租的承包地村委会不予确权，可以由乡级以上人民政府处理，或者到农村土地承包仲裁机构申请仲裁。
建议养殖业主在办理养殖大棚确权时，提前准备好所有必要的文件和资料，并严格按照相关流程进行申请和审核，以确保顺利获得不动产权证书。