污水中的微生物种类繁多，主要包括以下几类：
细菌：
细菌是污水处理中最主要的微生物群体，根据功能和代谢方式的不同，可以分为好氧细菌、厌氧细菌和兼性细菌。好氧细菌在有氧环境中生长，具有降解有机污染物的功能；厌氧细菌在无氧环境中生长，能够降解有机物并产生甲烷；兼性细菌则能够在好氧和厌氧环境中生长。
原生动物：
原生动物在污水处理中扮演着重要角色，它们能够吞噬和降解有机物，以及捕食细菌。原生动物通过自身的运动和与其他微生物的相互作用，影响污水中的物质循环和能量流动。
真菌：
真菌在污水处理中也有广泛的存在，它们能够分解复杂的有机物，如纤维素和木质素。真菌的分解产物，如真菌丝和孢子，可以作为营养源被其他微生物利用。
藻类：
藻类在污水处理中具有固碳、吸收营养物质和减少有机物的作用。它们通过光合作用产生氧气，有助于改善水质。
病毒：
病毒是由核糖核酸核心（DNA或RNA）组成，寄生于其他生物的细胞内。在污水处理中，病毒可能会激增，尤其是病原体污染的情况下。常见的病毒包括MS2、肠道病毒、诺沃克因子、轮状病毒等。
古菌：
古菌大小和细胞成分类似于细菌，对厌氧过程很重要。它们在缺氧环境中生存，并参与有机物的降解过程。
后生动物：
后生动物捕食水中的固体有机物、菌类、藻类和原生动物，有助于进一步净化水质。
这些微生物在污水处理过程中发挥着重要作用，通过不同的代谢途径降解和转化污水中的有机物，从而改善水质。不同类型的微生物在污水处理的不同阶段发挥着各自的优势，共同完成污水的净化任务。