借名买房的协议通常是不能进行公证的。根据《中华人民共和国公证法》和《中华人民共和国民法典》的相关规定，公证是对民事法律行为、有法律意义的事实和文书的真实性、合法性予以证明的活动。而借名买房合同存在法律上的风险，因为它违反了不动产物权设立、变更、转让和消灭需依法登记的原则。
尽管如此，当事人可以寻求其他法律途径来保护自己的权益。例如，可以找律师事务所进行借名买房协议的律师见证，并出具律师见证书。或者，直接找两名以上的见证人对该协议的签署进行见证，并在协议上签字确认。
需要注意的是，公证机构在受理公证申请时，会对当事人提供的证明材料进行严格审查，并在确认材料真实、合法、充分的情况下，向当事人出具公证书。但由于借名买房合同的法律效力存在争议，公证机构很可能不会受理此类公证申请。