处理违章扣3分的情况，可以参照以下步骤：
携带证件：
需要携带身份证、驾驶证和行驶证到违章处理大厅或交警大队进行办理。
确认违章信息：
将证件交给工作人员，工作人员会调出违法信息，确认是否为你的车辆违法，并打印处罚决定书。
缴纳罚款：
拿着处罚决定书到指定的银行或通过网上银行缴纳罚款。有些地区可能还支持在违章处理窗口直接缴纳罚款。
保留回执单：
缴纳罚款后，务必保留好罚款缴纳后的回执单。如果违章行为仍然在，可以拿着回执单去交警部门进行手动清除违章。
查询违章信息：
缴纳罚款后，过几分钟再查询违法信息，确认违章是否已清除。如果违法信息仍未消除，可以拿着交款单子到交警队的法制科说明情况，工作人员会帮助删除违法信息。
需要注意的是，记分周期为12个月，满分为12分。在一个记分周期内，记分未达到12分且所处罚款已经缴纳的，记分予以清除；记分虽未达到12分，但尚有罚款未缴纳的，记分转入下一记分周期。
建议：
尽早处理违章，避免超过15天的缴纳期限，以免产生滞纳金。
如果对违章有异议，可以申请行政复议。
处理违章时，确保所有证件齐全，并按照流程操作。