在洁净区，常用的消毒方法包括以下几种：
紫外线照射：
紫外线具有杀菌作用，能破坏微生物的DNA结构，从而达到消毒目的。在洁净车间内安装紫外线灯，定期照射一定时间，可有效杀灭空气中和表面的微生物。但紫外线消毒存在照射死角，对阴影部分的消毒效果不佳。
臭氧消毒：
臭氧具有强氧化性，能迅速杀灭细菌、病毒和真菌等微生物。通过臭氧发生器产生臭氧，并将其通入洁净车间进行消毒。臭氧消毒效果较好，但臭氧对人体有一定的危害，消毒时人员需要撤离。
化学消毒剂消毒：
使用化学消毒剂对洁净室进行消毒，如过氧化氢、二氧化氯等。这些消毒剂可以杀灭细菌、病毒和真菌等微生物，并具有较好的除臭作用。但需要注意化学消毒剂的浓度和使用方法，避免对环境和人体造成影响。
蒸汽消毒：
通过使用蒸汽发生器产生高温蒸汽，对实验室洁净区的表面和设备进行消毒。高温蒸汽能够杀灭各种微生物和细菌，同时不会对环境和人员造成污染。
等离子体消毒：
等离子体技术通过产生等离子体场，破坏微生物的细胞壁和细胞膜，从而达到消毒的目的。这种消毒方式具有高效、快速、无残留等优点，但设备成本相对较高。
酒精消毒：
使用75%的医用酒精或酒精棉片擦拭实验器材和手部，能够杀灭大部分细菌和病毒。需要注意的是，酒精易燃易爆，使用时应注意安全。
含氯消毒剂：
使用含氯消毒剂对实验室洁净区的表面进行消毒。含氯消毒剂具有强氧化性，能够杀灭各种微生物和细菌。但是需要注意，含氯消毒剂具有腐蚀性和刺激性，不能长时间使用。
在选择消毒剂时，需要综合考虑消毒效力、对人体和环境的危害、使用便捷性以及成本等因素。例如，对于需要极高消毒效果的A/B洁净区，过氧化氢消毒剂可以作为一种选择。同时，为了确保洁净区的持续洁净度，还需要定期进行清洁和消毒，并严格遵守消毒剂的配制和使用规范。