工厂科长在不同组织和体系中的级别有所不同：
企事业单位
在企事业单位中，科长通常被视为中层管理干部。他们在组织结构中处于部长或经理之下，主任之上，负责管理和指导本科室的工作。具体级别可能因单位性质和规模而异，有些情况下可能相当于正科级。
行政机关
在国家公务员体系中，科长一般处于9-13级，属于有责任的部门担任者。在县级政府部门中，科长是职级，相当于正科级；在地（市）级政府部门中，科长既是职位也是职级，有些情况下可能被称为处长，但实质上仍是正科级。
企业中的不同称谓
在日资企业或韩资台资企业中，科长有时也称为课长（かちょう）。
综合以上信息，可以得出结论：工厂科长在企业中通常被视为中层管理干部，具体级别可能为正科级或相当职位。在行政机关中，科长则属于国家公务员体系中的中层管理职级，级别范围在9-13级之间。