在自家两院中间留门，可以考虑以下几个步骤：
选定位置：
选择一个便利的地方作为大门的位置，通常是在视觉上显眼且通行方便的地方。
设计风格：
根据整体院落的风格，设计一个合适的门，尽量与周围环境和谐统一。可以选择木门、铁门或是其他材料，要考虑到美观与实用。
尺寸与功能：
确定门的尺寸，根据通行需要以及可能的使用频率来选择。例如，如果是家人出入频繁，可以考虑宽一点的双扇门。
基础施工：
清理门的位置，进行基础施工，确保门框稳固，可使用水泥或砖块加固。
门的配件：
安装门锁、铰链等配件，确保门的使用安全，并提高使用方便性。
美化处理：
门安装完成后，可以进行油漆、装饰或者植物搭配等，提升整体美观。
注意事项：
风水问题：从风水的角度来说，在自家两院中间留门是非常不吉利的，会将家里的财运全部挡住，还会聚集很多的煞气。如果非常在意风水问题，建议请当地靠谱的风水大师上门推算。
结构安全：在留门时，一定要注意不要破坏承重墙，如果承重墙出现损坏，后期房屋坍塌的可能性是非常大的。
使用方便：考虑门的使用频率和便利性，选择合适的门型和尺寸，确保门的使用安全。
整体美观：门的设计和安装应尽量与整体院落风格协调，可以通过油漆、装饰等手段提升美观度。
根据以上步骤和注意事项，可以合理地在两院中间留门，既方便出入又能增添院落的整体美感。