养殖灵芝除虫的方法有以下几种：
物理防治
利用防虫网、遮阳网等功能网隔离培菌室和芝棚，阻止害虫侵入。
使用紫外线和臭氧等装置对接种器具和栽培场所进行消毒。
化学防治
在必要时使用化学农药进行防治，但必须选择符合无公害农产品生产中可限制使用的品种及使用方法。
生物防治
利用天敌，如寄生蜂、捕食性瓢虫等控制害虫数量。
使用生物农药，如苏云杆菌、白僵菌等防治病害。
环境管理
保持芝场及周围环境的清洁卫生，及时清除受杂菌污染的菌棒，并进行芝场消毒除虫。
控制温度、湿度和通风换气，避免过高或过低的温度、过湿的环境和不良的通风条件导致病虫害的发生。
人工捕捉
对于害虫数量较少的情况，可以采取人工捕捉的方法进行除虫。
其他方法
将灵芝放进冰箱冷冻室一昼夜，将虫卵充分冻死。
将灵芝放在太阳下面充分地晒，以保持干燥和消毒，并将表层被蛀过的表皮撕掉，倒尽黑色的粉末。
建议
在实际养殖过程中，建议首先采用物理防治和生物防治方法，以减少对环境和灵芝本身的污染。
当害虫数量较多或病害严重时，再考虑使用化学农药，并确保使用方法和剂量符合相关标准。
定期对灵芝进行清洁和消毒，保持栽培环境的适宜条件，可以有效预防病虫害的发生。