办理历史祖屋的房产证需要遵循以下步骤：
准备材料
产权人的身份证原件及相关资料（如户口簿、老地契、村委会证明、乡（镇）政府审批意见等）。
如果房屋建设年代较早，可能还需要提供相关部门的证明文件或鉴定报告，以证明房屋的建设符合当时的规定。
申请与受理
申请人到房屋所在地的房管所提出申请，并填写相关申请表格。
当地房管所受理申请并进行初审，然后报市房管局审核。
审核与缮证
市房管局对申请材料进行审核，审核通过后缮证。
审核通过后，由当地房管所通知产权人领取《房地产权证》。
权籍调查与登记
在某些情况下，可能还需要进行权籍调查，确保房屋的权属清晰无争议。
最后，申请人需要到不动产登记窗口领取不动产登记证，完成整个产权确认程序。
建议
提前准备：提前准备好所有必要的材料，确保材料的真实性和完整性。
咨询当地房管部门：在办理过程中，咨询当地房管部门或不动产登记中心，了解具体的办理流程和所需材料，以确保办理过程顺畅。
注意时效：根据当地政策，注意办理房产证的时间要求，及时完成相关手续。