企业在新三板（全国中小企业股份转让系统）上市的主要流程包括以下几个步骤：
签订推荐上市协议
企业首先需要与券商签订推荐上市协议，明确双方的权利和义务。
满足新三板上市要求
企业需要满足新三板的上市标准，包括但不限于：
依法设立且存续期限符合规定年限的有限责任公司。
开户本人需要具备一定的股票交易记录。
提供符合要求的市值证券资产证明。
激活证券账户并移交开户资料。
股改程序
企业需要启动股改程序，由有限公司以股改基准日经审计的净资产值整体折股变更为股份公司。
尽职调查
主办券商对拟上市的公司进行尽职调查，包括财务、法律、业务等方面的全面审查，并编制推荐挂牌备案文件，同时承担推荐责任。
内核机构审核
主办券商设立内核机构，对备案文件进行审核，并出具内核意见。内核机构负责审查企业的基本情况、财务状况、公司治理、合法合规性等，并决定是否推荐上市。
中国证券业协会审核
审核通过后，主办券商将备案文件上报至中国证券业协会进行审核。中国证券协会对备案文件进行审查，并作出是否备案的决定。
完成挂牌
审核通过后，企业可以正式在新三板挂牌上市。挂牌后，企业还可以根据自身情况考虑向更高层级的市场，如创业板或科创板转板。
后续融资与发展
企业在新三板挂牌后，可以通过定向增发股份、股份转让等方式进行融资，提高公司信用等级和市场关注度，并实现资产增值。
整个上市流程的时间长度因企业具体情况和市场环境的变化而有所不同，但一般需要6到9个月左右。建议企业在准备上市过程中，提前规划，选择合适的中介机构，确保所有材料的准确性和合规性，以提高上市成功率。