观察细菌通常需要使用光学显微镜和电子显微镜。
光学显微镜
普通光学显微镜：这是最常见的显微镜类型，使用可见光照明样品，并通过透射或反射光学系统放大和观察样品的细节。对于细菌的观察，通常采用亮场、暗场、差分干涉等技术。普通光学显微镜在最佳条件下，最大分辨率为波长的一半，即0.25μm，用油镜放大1000倍，可以将0.25μm的微粒放大到0.25mm，肉眼可以看清，一般细菌大于0.25μm，因此普通光学显微镜适用于观察细菌的形态和结构。
暗视野显微镜：这种显微镜通过特制的暗视野集光器代替普通光学显微镜上的明视野集光器，使背景视野黑暗无光，从而在强光的照射下，可以在黑暗的背景中看到发亮的菌体，适用于观察未染色的活细菌和螺旋体的形态及运动。
相差显微镜：通过调整光路使得光程差产生明暗差异，适用于观察未染色的透明样本，如活细菌。相差显微镜可以提高对样品细节的对比度，使细菌在背景中更为清晰可见。
荧光显微镜：通过使用荧光染料标记样品中的生物分子，可以使细菌在特定波长的激发光下发射荧光，适用于观察特定结构或活性的细菌，如蛋白质、核酸等。
电子显微镜
透射电子显微镜（TEM）：通过透射样品的电子束来获取高分辨率图像，适用于观察细菌的内部结构，可以揭示细胞膜、质体、核区等超微结构的细节。
扫描电子显微镜（SEM）：通过扫描样品表面的电子束来获得三维表面形貌图像，适用于观察细菌的表面形貌和外部结构，如菌丝、菌胞等，提供高分辨率的图像。
建议
普通光学显微镜适用于初步观察细菌的形态和结构，特别是在教学和研究中。
暗视野显微镜和 相差显微镜对于观察未染色的活细菌特别有用，可以提高观察的对比度和清晰度。
荧光显微镜和 电子显微镜适用于需要观察细菌内部结构或特定生物分子的研究，但需要更高的专业知识和设备。
选择合适的显微镜类型，并根据具体研究需求选择合适的放大倍数和观察技术，可以更有效地观察和研究细菌。